172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3699 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  99.32 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  96.62 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  95.95 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  78.08 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  76.39 
 
 		 147 aa  233  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  75 
 
 		 147 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  75 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  75.69 
 
 		 147 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  67.74 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  70.69 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  62.14 
 
 		 146 aa  176  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  66.1 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  56.43 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  59.56 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  56.03 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.46 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.67 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  45.67 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  46.34 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  46.34 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  42.36 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  44.35 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  44.35 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  43.44 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.54 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.14 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.43 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.01 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.6 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  41.6 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.25 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  40.8 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  42.74 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  39.39 
 
 		 569 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  41.73 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  41.27 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  42.19 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  40.94 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  38.93 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  40.98 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  37.21 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  39.17 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  37.4 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  37.4 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  40.31 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  36 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  38.4 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  37.6 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.36 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  37.01 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  36.8 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  36.07 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  35.83 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  37.7 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  38.98 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  34.07 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  37.5 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  38.6 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  35.77 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  34.43 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.21 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.21 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  35.48 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.21 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  35.2 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  35.43 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  33.59 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  32.8 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  36.43 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  36.36 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0968  hypothetical protein  33.6 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00811816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>