178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2778 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  57.45 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  57.45 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  55.56 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  55.3 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  56.03 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  56.03 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  56.03 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  55.32 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  58.06 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  56.69 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  53.38 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  58.77 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  42.34 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  41.61 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  40.94 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  43.85 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.14 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.86 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  41.73 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  42.61 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  42.62 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  38.17 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  42.98 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  34.92 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.85 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  39.2 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.38 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.31 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  34.13 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  35.16 
 
 		 569 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  37.59 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  45.95 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  42.31 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  36.07 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  39.39 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  47.01 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  36.29 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  41.74 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.64 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  36.72 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  37.19 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  39.5 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  38.58 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0968  hypothetical protein  34.92 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00811816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  38.64 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.24 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.97 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.24 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  43.24 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.61 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.24 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.24 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  36.59 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 136 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4091  Fe-S metabolism associated SufE  45.9 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  38.4 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  38.39 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1528  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.31069  normal  0.111344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  34.4 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4451  Fe-S metabolism associated SufE  32.79 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700475  hitchhiker  0.0000330295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  39.32 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  29.51 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  32.26 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  35.4 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  35.34 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02427  putative selenocysteine lyase  35.11 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  37.17 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  35.4 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  37.17 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  37.17 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  38.26 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  34.96 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  31.15 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  31.01 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  32.81 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  32.52 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>