153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02427 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02427  putative selenocysteine lyase  100 
 
 		 130 aa  269  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.09 
 
 		 572 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  38.98 
 
 		 569 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  35.34 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  33.85 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  37.19 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  35.54 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  35.29 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  31.15 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  32.77 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  33.06 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  32.31 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  34.4 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  30.65 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  33.87 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.16 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  35.45 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  29.57 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  33.87 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  33.87 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.9 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1528  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.31069  normal  0.111344 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  29.46 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  35.85 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  30.3 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  32.2 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00811816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  25.41 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  27.69 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4091  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  33.88 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  26.23 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  32.73 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  31.25 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  26.83 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  33.87 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  29.41 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  29.31 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  24.59 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  31.9 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  30.16 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  28.95 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  30.77 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  26.92 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.76 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  28.83 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  26.61 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  28.32 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  26.72 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  28.32 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  25.89 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  28.23 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  28.04 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  27.13 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  26.79 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  25.89 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  25.89 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  34.71 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1164  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  34.55 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  27.48 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.01 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.55 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.55 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.55 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.55 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  25.89 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>