184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0766 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  72.11 
 
 		 145 aa  216  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  71.53 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  66.43 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  66.43 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  66.43 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  64.34 
 
 		 147 aa  190  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  63.51 
 
 		 148 aa  189  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  70.16 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  70.16 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  70.16 
 
 		 148 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  69.35 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  66.15 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  55.94 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  64.17 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  53.52 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  48.39 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  48.8 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  47.66 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  46.88 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  48.39 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.06 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.89 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  46.03 
 
 		 569 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  42.36 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  42.45 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  44.68 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.19 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  43.2 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  44.54 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  43.8 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.54 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  42.98 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.98 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.54 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.54 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.54 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  41.79 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  43.86 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  43.85 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.62 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  39.85 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  42.97 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  43.08 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  41.86 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  44.8 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  41.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  41.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  38.64 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  43.97 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.36 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  41.67 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  36.84 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.5 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  38.76 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  38.76 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  41.32 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  40.83 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  38.76 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  39.67 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  43.9 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  40.83 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.34 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  36.67 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  37.69 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  41.96 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  38.71 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.89 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  37.19 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  39.17 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.19 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  35.2 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.19 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4091  Fe-S metabolism associated SufE  44 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  37.3 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  37.29 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  38.02 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  39.83 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  38.21 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  40.8 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  36.67 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  42.4 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  33.6 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  36.07 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>