192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1091 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  73.13 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  70.9 
 
 		 135 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  65.65 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  64.62 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  69.17 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1528  Fe-S metabolism associated SufE  69.92 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.31069  normal  0.111344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  69.92 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1137  Fe-S metabolism associated SufE  65.41 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4091  Fe-S metabolism associated SufE  68.94 
 
 		 136 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  66.67 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  43.31 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  41.73 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  43.8 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  43.2 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  46.67 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  38.35 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  42.97 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  42.31 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  39.37 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  41.86 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  41.86 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  39.85 
 
 		 569 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  34.88 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  41.94 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  42.97 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  41.94 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  37.7 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  41.13 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.16 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  41.27 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  40.8 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  42.19 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  41.27 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  39.68 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  38.52 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  41.73 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  39.17 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  38.58 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  39.53 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.98 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  37.88 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.15 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  35.61 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  38.4 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  41.27 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.1 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.22 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  34.59 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  35.25 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  39.39 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  38.58 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  39.5 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  32.54 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  35.59 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  38.02 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  35 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  36.13 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  33.58 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  33.9 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.17 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  38.46 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  36.97 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  38.46 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  41.74 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>