187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0689 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  100 
 
 		 145 aa  305  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  66.67 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  67.39 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  64.49 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  42.55 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  46.51 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  44.62 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  47.11 
 
 		 569 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  49.56 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  43.94 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  42.07 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  42.07 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  43.94 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  45.97 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  43.94 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  48 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  42.07 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  44.63 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  44.85 
 
 		 152 aa  120  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  40.29 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  44.35 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  41.26 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  41.26 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  43.9 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  43.9 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.86 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.14 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  43.31 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  45.53 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  49.58 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  43.09 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.73 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  39.39 
 
 		 147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  42.06 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.04 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  45.61 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  41.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  41.3 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  44.62 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.98 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  48.18 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  41.35 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  38.3 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  46.96 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  43.85 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  43.85 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  45.22 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  40.98 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  42.86 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  44.14 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  43.75 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  42.61 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  45.69 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  43.48 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  43.55 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  40.94 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  44.25 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  45.79 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  42.61 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  41.38 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  41.44 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  44.44 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  40.48 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  40.48 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  39.37 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  43.44 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 164 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  40.71 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 572 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  39.85 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  41.07 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  46.02 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  40.18 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  38.93 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  44.14 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  42.15 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  41.46 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  43.65 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  37.5 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  41.82 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  37.5 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  37.5 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  40.87 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>