173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3181 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  100 
 
 		 147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  70.55 
 
 		 151 aa  214  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  70.34 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  71.23 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  64.75 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  64.75 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  64.03 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  64.49 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  56.52 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  56.52 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.21 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.21 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.21 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.21 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  57.58 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  57.46 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  55.8 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  56.52 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  45.26 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  43.8 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  42.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  40.54 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  39.39 
 
 		 145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  41.35 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  40.43 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  41.35 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  41.41 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  38.52 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  39.72 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  39.01 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  40.16 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  41.13 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  39.01 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  40.48 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  39.26 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  38.76 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  42.74 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  40.74 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  39.67 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  41.23 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  40.32 
 
 		 164 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  37.01 
 
 		 569 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  43.55 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  38.84 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  39.84 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  38.64 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4451  Fe-S metabolism associated SufE  38.66 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700475  hitchhiker  0.0000330295 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  34.07 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  34.03 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.5 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  36.64 
 
 		 152 aa  90.5  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  35.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  35.82 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  36.75 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  34.85 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  42.74 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  37.5 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  34.38 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  35.71 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  36.51 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.22 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  36 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  35.66 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  36.92 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  33.88 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  33.87 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  35.04 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  35.04 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  32.82 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  35.9 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  34.29 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  35.9 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  33.06 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  33.06 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>