178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2952 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  98.64 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  97.96 
 
 		 147 aa  296  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  97.96 
 
 		 147 aa  296  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  85.62 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  85.62 
 
 		 147 aa  260  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  85.62 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  85.62 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  85.62 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  74.66 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  65.35 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.9 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  60.87 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  58.52 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  58.52 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  57.78 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  56.52 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  59.17 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  45.71 
 
 		 142 aa  129  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  46.26 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  45.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  45.67 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  44.09 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  44.19 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  40.44 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  43.41 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  38.51 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  43.31 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  43.41 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  42.14 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  42.64 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  42.64 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  40.67 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  40.88 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  38.52 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  44.54 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  41.22 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  47.01 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  39.46 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  41.22 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  42.52 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  40.48 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  39.68 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  39.68 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  42.4 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  38.52 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  40.98 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  40.94 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.43 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  35.38 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  37.21 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  43.09 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  37.21 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  42.31 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  37.8 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  39.37 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  35.82 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  38.02 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  39.37 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  38.4 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  44.17 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  37.8 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  40.78 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  40.35 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  37.4 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  35.77 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  38.4 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  37.59 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  41.67 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  38.05 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  35.77 
 
 		 569 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1164  Fe-S metabolism associated SufE  42.99 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  38.83 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  38.02 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  37.04 
 
 		 164 aa  83.6  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  35.16 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  34.96 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  34.96 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  36.13 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  34.96 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>