177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0752 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  61.81 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  65.04 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  59.7 
 
 		 148 aa  163  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  56.43 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  56.43 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  63.03 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  63.41 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  64.71 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  57.14 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  66.39 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  56.43 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  57.14 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  62.18 
 
 		 148 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  63.96 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  56.69 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  52.17 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  48 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  48.33 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  49.17 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40.41 
 
 		 569 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  41.22 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.01 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  47.01 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  47.01 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.38 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  42.74 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  43.59 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  40.46 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  39.39 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.35 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.35 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.35 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  44.35 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  44.35 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  45.22 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  42.02 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  45.38 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  38.66 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  42.37 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  40 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  41.59 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  40.58 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.58 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  40.58 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  40.52 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  42.48 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  39.66 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  38.98 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  45.69 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  39.17 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  40.52 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  40.35 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  37.12 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  37.12 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  39.47 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  38.46 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  41.88 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  37.93 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  38.84 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  36.59 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  39.32 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  39.5 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  39.66 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  39.82 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  41.18 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0968  hypothetical protein  39.67 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00811816  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  37.93 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  39.82 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  39.82 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  36.21 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  35.9 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  34.69 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  41.59 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  38.79 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  35.61 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  38.66 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  37.61 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  35.88 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  36.84 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 572 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  39.66 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  36.13 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4451  Fe-S metabolism associated SufE  38.53 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700475  hitchhiker  0.0000330295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  38.14 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.93 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  38.26 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  40.78 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  39.5 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>