172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1517 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  99.28 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  99.28 
 
 		 138 aa  283  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  99.28 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  88.41 
 
 		 138 aa  254  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  88.41 
 
 		 138 aa  254  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  87.68 
 
 		 138 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  87.68 
 
 		 138 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  87.68 
 
 		 138 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  81.88 
 
 		 138 aa  239  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  71.85 
 
 		 137 aa  205  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  68.84 
 
 		 140 aa  200  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  68.12 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  68.12 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  71.53 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  70.07 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  64.96 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  56.93 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  41.48 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  42.75 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  38.93 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  39.1 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  43.2 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  40.77 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  39.84 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.69 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  41.22 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  40.31 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  40.98 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  37.04 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  36.15 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  42.06 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  40.31 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  41.38 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.3 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  39.68 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  38.76 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  37.12 
 
 		 569 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  40.94 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  41.41 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  39.5 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  36.72 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  40.31 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  38.76 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  38.71 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  38.64 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  38.76 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  40.6 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  40.15 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  38.52 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  35.88 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  42.34 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  38.06 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  38.06 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  38.06 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  37.4 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  36.69 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.82 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  35.11 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  38.06 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  35.88 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  36.51 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  33.85 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  34.78 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  37.88 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  41.41 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  32.85 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  32.81 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  35.88 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  35.88 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  34.35 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  37.5 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  36.03 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  32.82 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  36 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  36.97 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.81 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  38.33 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  29.77 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  31.54 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  36.36 
 
 		 145 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.28 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  33.81 
 
 		 142 aa  85.9  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  34.4 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.15 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  36.8 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>