192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0163 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  49.31 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  45.21 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  47.55 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  44.22 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  43.06 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  40.14 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  44.6 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  44.68 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  42.31 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  41.54 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  37.59 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  40.88 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  39.23 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  37.78 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  43.8 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  36.23 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  37.4 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  38.17 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  39.86 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  39.69 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  39.26 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  36.92 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  38.93 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  39.84 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  39.13 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  38.52 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  35.66 
 
 		 145 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  37.04 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  37.31 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  39.2 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  38.46 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  37.98 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  35.77 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  37.31 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  34.62 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  38.13 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  34.88 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  38.46 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  37.69 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  36.22 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  33.85 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  36.43 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  40.87 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  34.96 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  33.85 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  33.08 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  36.64 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  32.35 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.57 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  31.54 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  35.38 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  32.12 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  34.81 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.68 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  28.68 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.78 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  30.23 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1338  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  35.61 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  29.2 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.93 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  31.54 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  29.63 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  33.62 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  33.82 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  38.33 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  34.11 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  30.43 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  31.78 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  36.21 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  26.12 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  34.07 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  31.06 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1164  Fe-S metabolism associated SufE  31.75 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  29.17 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  30.23 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  31.06 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  30 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  32.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  29.55 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  29.17 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>