187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7639 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  47.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  48.33 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  45.9 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  47.15 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  47.5 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  47.5 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  47.54 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  48.74 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  41.94 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  42.15 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  40.65 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  42.62 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  39.84 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  39.52 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  39.84 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  40.32 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  38.33 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  42.39 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  35.9 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  39.32 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  36.97 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  35.59 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  33.33 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  35.9 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  35.54 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  32 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  34.48 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  36.28 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  34.19 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  35.2 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  33.88 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  34.19 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  36.21 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  34.19 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.62 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  37.72 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  33.61 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  38.33 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  32.76 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  35.04 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  33.04 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  33.61 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  33.61 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  32.46 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  31.71 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  33.88 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  34.71 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  35.45 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  32.48 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  32.2 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  31.62 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  31.67 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  29.41 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  28 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  28 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  29.75 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  32.8 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  31.93 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  31.97 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  30.43 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  32.5 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  34.45 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  29.66 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  30.58 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  29.84 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  31.15 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  32.23 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  33.05 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  33.64 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  35.14 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  33.61 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  27.73 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  29.03 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.62 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.93 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.93 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.93 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  31.93 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  29.06 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  29.36 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.93 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  30.19 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  30.19 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  31.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>