188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08891 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  72.99 
 
 
140 aa  207  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  70.07 
 
 
147 aa  204  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  58.87 
 
 
154 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  58.16 
 
 
154 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  59.03 
 
 
175 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  54.26 
 
 
138 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  54.26 
 
 
139 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  54.26 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  53.49 
 
 
141 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  53.49 
 
 
144 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  51.59 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  48.82 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  49.61 
 
 
144 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  48.82 
 
 
144 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  37.88 
 
 
147 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  41.94 
 
 
124 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  35.11 
 
 
139 aa  99  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  33.6 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  33.6 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  32.14 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  37.27 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.6 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  39.32 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  34.15 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  39.47 
 
 
139 aa  87  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  35.09 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  30.4 
 
 
141 aa  84.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  36.96 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  35.82 
 
 
142 aa  84  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  30.71 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  35.71 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  33.86 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  30.53 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  30.53 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  33.83 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  30.4 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  39.02 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  30.28 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  29.77 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  33.56 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  37.1 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  33.56 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  35.51 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  42.22 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  38.24 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  35.38 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  32.88 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  37.07 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  36.44 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  36.21 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  36.21 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  36.13 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  33.83 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  33.08 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  32.82 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  34.07 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  38.66 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.76 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  38.26 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  28.35 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  27.56 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  29.85 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  37.9 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  35.9 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  27.56 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  31.75 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.08 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  29.37 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  32.79 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  26.81 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  32.82 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  27.91 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  31.82 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  30.36 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  30.97 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  32.23 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  30.3 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  30.97 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  28.07 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  29.13 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>