183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0701 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  96.1 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  58.16 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  61.11 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  56.52 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  55.8 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  61.72 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  58.52 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  60.16 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  58.4 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  51.16 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  48.15 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  48.15 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  48.82 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  48.82 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  46.46 
 
 		 144 aa  130  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  49.61 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  39.2 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  39.06 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  39.52 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  36.89 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  37.98 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  34.31 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  34.4 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  36.07 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  40.35 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  38.38 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  35.61 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  29.23 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  31.39 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  39.13 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  33.61 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  34.19 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  32.65 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  33.6 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  34.59 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  32.23 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  31.34 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  28.91 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  30.83 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  31.5 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  30.08 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  29.55 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  30.83 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  30.53 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  31.67 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  40.2 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  30.65 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  31.5 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  28.79 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  31.2 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  29.32 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  33.59 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  28.79 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  33.59 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  31.82 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3182  Fe-S metabolism associated SufE  32.77 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  33.05 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  32.82 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  33.93 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  34.65 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  27.61 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  31.67 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  27.4 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  29.08 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  28.36 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  32.31 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  32.82 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  25.9 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  28.36 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  25.9 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  26.43 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  27.74 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  31.69 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  33.98 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.41 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  29.1 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  29.92 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  28.37 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  32.23 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  31.9 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  31.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>