176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1063 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  92.81 
 
 		 139 aa  255  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  94.12 
 
 		 138 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  82.73 
 
 		 141 aa  229  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  61.72 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  60.16 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  52.9 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  61.54 
 
 		 175 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  54.26 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  51.45 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  53.12 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  52.76 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  52.76 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  51.54 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  49.22 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  47.69 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  49.61 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  39.84 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  37.3 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  35.94 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  34.65 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  39.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  44.44 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  37.6 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  38.83 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  34.38 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  29.63 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  32 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  29.2 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  37.27 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2184  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000219554  hitchhiker  0.00000283333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  36.21 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  29.37 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  28.35 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  33.87 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  32.81 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  27.21 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  33.91 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  33.85 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  31.2 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  32 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  29.55 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  33.04 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  33.04 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  27.48 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  32.31 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  28.15 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  27.61 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  31.2 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  28.03 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  31.86 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  28.15 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  29.32 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  32.76 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2393  cysteine desufuration protein SufE  33.62 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  hitchhiker  0.0000615703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  28.99 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  30.3 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  28.03 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01648  cysteine desufuration protein SufE  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000768854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1963  Fe-S metabolism associated SufE  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000464178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01638  hypothetical protein  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000509918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1517  cysteine desufuration protein SufE  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000018022  hitchhiker  0.000000327732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  32.58 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1952  cysteine desufuration protein SufE  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000146804  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1760  cysteine desufuration protein SufE  32.76 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  28.8 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  29.03 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  31.06 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1880  cysteine desufuration protein SufE  31.9 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1699  cysteine desufuration protein SufE  30.77 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000746018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.01 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  28.26 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3790  hypothetical protein  28.12 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  27.97 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  28.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  28 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  35.87 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  32.67 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  30.1 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  27.83 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  27.48 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>