173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2220 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  56.52 
 
 
150 aa  165  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  55.8 
 
 
152 aa  157  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  50.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  44.06 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  40.82 
 
 
156 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  43.88 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  43.28 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  44.36 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  42.45 
 
 
148 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  40.6 
 
 
136 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  42.36 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  42.14 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  45.86 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 
149 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  40.58 
 
 
144 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  40.6 
 
 
138 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  40.6 
 
 
138 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  40.6 
 
 
138 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  43.55 
 
 
145 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  35.66 
 
 
167 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  32.86 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  31.34 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  32.62 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  30.4 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  34.45 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  32.8 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  33.61 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  32.77 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  35.87 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  32.8 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  33.06 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  31.93 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  28.45 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  31.15 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  27.4 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  29.17 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  28.79 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  24.79 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  29.93 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  29.06 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  33.7 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  29.2 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  29.66 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  24.43 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  28.35 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  24.17 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  28.33 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  27.97 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  28.1 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  24.26 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  25.86 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  31.11 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  27.78 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  26.15 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  27.48 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  26.27 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  26.89 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  31.9 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  27.48 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  24.17 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  27.87 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  24.79 
 
 
150 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  27.86 
 
 
140 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  30.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  26.45 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  30.07 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  27.05 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  27.05 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  25.93 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  23.08 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  28.21 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  24.44 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  28.68 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  27.12 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1487  cysteine desufuration protein SufE  24.8 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0255513  hitchhiker  0.000000000108827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  26.23 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1471  cysteine desufuration protein SufE  24.8 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00486624  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1797  cysteine desufuration protein SufE  24.8 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000335199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1506  cysteine desufuration protein SufE  24.8 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000138977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1968  cysteine desufuration protein SufE  24.8 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0109106  hitchhiker  0.0000000878422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>