25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1978 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 151 aa  316  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  30.07 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  29.79 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  29.08 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  34.03 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  31.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  30.99 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  30.87 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  31.11 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  28.06 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  28.06 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  29.31 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  27.34 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  27.66 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  28.81 
 
 		 151 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  26.24 
 
 		 144 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  25.5 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  28.28 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>