65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0984 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  42.31 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  39.72 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  36.5 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  40.3 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  40.44 
 
 		 156 aa  94.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  42.28 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  41.09 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  39.02 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  35.97 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  40.31 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  38.69 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  38.58 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  39.04 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  38.76 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  42.31 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  39.26 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  36.97 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  37.16 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  34.45 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  38.69 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  34.81 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  33.91 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  28 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  33.09 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  25.35 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  22.95 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  32.35 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  26.72 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  26.67 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  24.44 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  24.8 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  25.19 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  24.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  26.56 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  26.67 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  30.56 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  25.58 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  23.97 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  26.57 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  27.05 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  28.15 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  22.79 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  23.28 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  28.15 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  24.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  29.31 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.13 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  26.15 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  28.35 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  22.06 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  26.27 
 
 		 150 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  24.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  21.55 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  28.28 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  31.62 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  26.77 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>