125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0718 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  87.25 
 
 		 152 aa  264  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  56.52 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  45.32 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  41.04 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  43.88 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  41.01 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  40 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  40.97 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  41.48 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  48.89 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  41.04 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  41.91 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  38.3 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  39.72 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  42.34 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  45.11 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  42.45 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  38.1 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  32.39 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  34.07 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  30.99 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  30.99 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  30.99 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  31.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  32.19 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  30.66 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  33.87 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  31.11 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  32.12 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  34.51 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  30.95 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  29.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  28.26 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  30.66 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  28.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  32.11 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  29.25 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  26.92 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  31.34 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  27.2 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.77 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  29.77 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.34 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  25.19 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  24.43 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  28.44 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  34.38 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  24.6 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  29.93 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  28.35 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0734  Fe-S metabolism associated SufE  32.14 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  23.85 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  23.81 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  30.47 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  29.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  32.81 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  28.67 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  27.64 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  28.67 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  26.45 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  26.09 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  25.42 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  22.66 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  29.69 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  27.82 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0766  Fe-S metabolism associated SufE  30.63 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  30.87 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1528  Fe-S metabolism associated SufE  29.2 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.31069  normal  0.111344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  27.5 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  27.21 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4196  Fe-S metabolism associated SufE  29.93 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  24.29 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  28.46 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0597  Fe-S metabolism associated SufE  22.96 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  27.91 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  28.32 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  29.06 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  30.68 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  24.6 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>