69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2651 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 
151 aa  294  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  58.28 
 
 
148 aa  169  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  60.67 
 
 
150 aa  166  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  58.16 
 
 
153 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  55.1 
 
 
155 aa  156  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  57.72 
 
 
153 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  50 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  52.21 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  52.82 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  50.35 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  51.08 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  47.68 
 
 
167 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  48.18 
 
 
138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  48.18 
 
 
138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  48.18 
 
 
138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  44.68 
 
 
156 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  42.45 
 
 
150 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  46.15 
 
 
145 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  46.15 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  41.01 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  42.14 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  44.36 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  39.26 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  32.79 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  29.86 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  32.8 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  32.39 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  28.37 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  24.32 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  29.91 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  31.06 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  32.22 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  32.5 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  33.1 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  29.73 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  30.25 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  27.03 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  23.94 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  23.21 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  29.52 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  32.22 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  32.46 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  43.9  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  43.9  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  33.04 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  34.09 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  25 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  26.72 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  23.42 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  31.67 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  23.21 
 
 
142 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  28.81 
 
 
151 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  23.53 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  22.69 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  26.67 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  31.11 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28143  predicted protein  29.67 
 
 
579 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138283  normal  0.0426817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  28.17 
 
 
152 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>