91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2300 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 
146 aa  293  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  79.72 
 
 
145 aa  229  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  50.35 
 
 
156 aa  133  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  45.32 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  46.27 
 
 
152 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  46.76 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  45.65 
 
 
143 aa  116  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  44.03 
 
 
136 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 
138 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 
138 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 
138 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  42.42 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  46.1 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 
153 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  41.48 
 
 
149 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  40.14 
 
 
148 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  43.06 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 
153 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  40.69 
 
 
167 aa  100  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  46.15 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  40.3 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  36.55 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  33.09 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  33.81 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  33.81 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  31.47 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.1 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  30.07 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.29 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  30.7 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  30.7 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  30.17 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  25.93 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  25.9 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  32.61 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  28.03 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  26.47 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  26.15 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  29.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  31.16 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  25.95 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  25.56 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  24.19 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  25.83 
 
 
141 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  22.94 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.36 
 
 
147 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  27.19 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  23.85 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  24.55 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  27.52 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  24.24 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  22.94 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  26.09 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  25.22 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  29.35 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  25.69 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  23.44 
 
 
151 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  26.61 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  21.9 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  21.37 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  24.55 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  26.32 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  24.79 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  24.35 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  23.93 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  23.28 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  22.41 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  23.28 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  23.48 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  23.48 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  22.81 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  26.17 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  22.94 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  24.77 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  23.85 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  27.73 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  22.73 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  25.93 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  21.74 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  21.82 
 
 
144 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  24.55 
 
 
136 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  23.66 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  21.74 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  23.64 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  21.3 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>