55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  100 
 
 		 167 aa  327  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  53.52 
 
 		 152 aa  147  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  51.43 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  53.19 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  57.66 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  47.92 
 
 		 148 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  50.36 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  47.68 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  47.55 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  47.45 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  40 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  45.99 
 
 		 137 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  43.8 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  37.67 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  36.42 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  40.69 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  38.85 
 
 		 145 aa  92  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  35.66 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  34.81 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  31.06 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  32.58 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  30.82 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  25.19 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  25.6 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.77 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  29.01 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  25.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  22.14 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  28.28 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  25.76 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  26.06 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  26 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  25.18 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  29.31 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  26 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  24.65 
 
 		 142 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  25.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  25.4 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>