106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1033 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 144 aa  280  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  71.97 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  71.11 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  70.9 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  70.37 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  68.18 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  68.18 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  68.18 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  60.14 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  60.42 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  61.43 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  55 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  51.41 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  55.22 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  45.93 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  50 
 
 		 167 aa  123  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  40.14 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  46.62 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  42.42 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  46.62 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  39.44 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  36.97 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  39.6 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  31.45 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  31.25 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  29.6 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  29.77 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  26.98 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  28.81 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.69 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  27.91 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  28.81 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  34.78 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  28.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  30.65 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  26.98 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  30.3 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  31.01 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  31.01 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  31.3 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  26.36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  26.89 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  30.17 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  22.96 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  28.23 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  25.37 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  24.63 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  27.94 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  29.13 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  28.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  24.24 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  24.24 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  28.68 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  28.67 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  29.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  27.69 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  29.77 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  26.4 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.92 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  31.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  30.66 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  26.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  29.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  24.62 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  30.16 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  32.18 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3311  chain A, Northeast Structural Genomic Consortium Target Er75  27.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.09 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3211  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3196  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.78287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3148  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  26.15 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3131  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0738734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  24.81 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  26.56 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  28.12 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  34.12 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  27.42 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>