83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1339 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  79.72 
 
 		 146 aa  229  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  48.92 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  46.48 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  43.28 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  44.53 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  41.04 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  44.78 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  46.76 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  44.12 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  40.14 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  45 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  45.83 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  43.84 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  45.3 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  46.15 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  36.5 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  41.67 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  42.74 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  38.85 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  29.1 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  29.31 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  28.79 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  28.79 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  27.14 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  28.18 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  29.23 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  26.43 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  24.26 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  28.93 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  30 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  24.29 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  24.17 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  28.1 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  30.69 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  26.05 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  24.62 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  22.02 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  24.79 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  23.57 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  28.89 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  23.73 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  27.03 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  26.09 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  25.47 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  23.64 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  24.58 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  24.55 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  24.79 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  25.45 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  23.64 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  22.94 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  22.02 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  23.53 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  23.89 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  23.73 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  23.73 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  23.81 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  23.28 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  22.73 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  25.69 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  21.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  24.55 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  26.67 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0599  hypothetical protein  26.42 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  22.88 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  22.73 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  22.03 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  26.17 
 
 		 140 aa  40  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  26.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  25.23 
 
 		 151 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  22.22 
 
 		 150 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  27.17 
 
 		 109 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>