94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0233 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 137 aa  273  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  34.45 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  32.52 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  32.06 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  30.33 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  32 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  33.86 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  27.97 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  29.51 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  28.36 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.91 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  30.08 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  32.8 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  25.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  26.96 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  29.69 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  29.84 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  25.81 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  32.26 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  26.83 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  29.27 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  32.26 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.09 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  28.32 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  28.07 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.06 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  27.35 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  26.09 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  24.19 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  28.35 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  27.12 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  27.12 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  28.69 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  24.17 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  31.93 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  30.17 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  33 
 
 		 572 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  30.4 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  32.17 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  26.02 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  28.21 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  29.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  29.41 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  28.93 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  27.59 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  29.6 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  31.93 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  28.68 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  26.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  28.78 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  29.84 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  31.9 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  25.42 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  27.74 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  31.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  26.72 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  29.41 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  31.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2997  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  33.98 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.736409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  30.43 
 
 		 569 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  25.81 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  31.06 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  31.11 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  26.87 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  24.58 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  31.52 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  25.83 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  26.23 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  26.43 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  27.41 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  27.41 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  31.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1895  cysteine desufuration protein SufE  31.13 
 
 		 138 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000720615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  29.03 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  24.47 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  29.03 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  26.61 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  31.78 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  26.09 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  32.56 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  26.23 
 
 		 142 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>