110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1834 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  71.97 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  66.67 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  66.67 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  65.93 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  61.76 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  61.76 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  61.76 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  57.45 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  55.63 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  53.85 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  53.96 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  56.43 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  52.82 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  50.36 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  44.85 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  42.22 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  46.76 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  43.7 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  41.48 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  46.04 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  35.97 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  42.11 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  33.08 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  29.71 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  27.61 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  27.61 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  35.56 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  29.63 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  28.06 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  27.07 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  32.59 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  27.2 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  36.3 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  30.88 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  29.85 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  28.81 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  28.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  28.24 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  26.87 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  27.41 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  25.76 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  29.1 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  27.94 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  27.94 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  29.2 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  29.37 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  31.3 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  24.6 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  28.03 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  31.69 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  25.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  27.54 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  27.13 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  28.89 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  28.57 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  28.45 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  26.15 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  27.27 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  32.12 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  29.46 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  27.69 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  32.58 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  29.1 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  25.89 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  34.44 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  27.59 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28143  predicted protein  31 
 
 		 579 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138283  normal  0.0426817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  28.21 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  23.85 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  28.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  26.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  29.51 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.85 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  31.45 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  25.93 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  28.07 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>