82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3080 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  59.73 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  57.05 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  57.45 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  57.75 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  54.29 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  57.72 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  55.88 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  57.66 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  51.41 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 		 136 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  47.83 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  42.45 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  43.88 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  48.23 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  45 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  40.29 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  43.28 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  41.09 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  31.39 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0233  Fe-S metabolism associated SufE  30.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  28.15 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  30.07 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.01 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.11 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  21.48 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  25.53 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  27.61 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  25.19 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  34.48 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  28.37 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  22.83 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  31.34 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  22.83 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  27.41 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  31.34 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  28.03 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  27.34 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  23.4 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  23.57 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  31.47 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  22.83 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  24.29 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  24.29 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  32.87 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  27.94 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  28.1 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  31.16 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  25.58 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  27.27 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  29.63 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  25.98 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  27.74 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  26.53 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2944  Fe-S metabolism associated SufE  26.24 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  26.81 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  25.78 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1164  Fe-S metabolism associated SufE  27.46 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  30.34 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  27.94 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  25.9 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  22.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  22.54 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  26.87 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  29.1 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  23.88 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  24.63 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>