101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1658 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 
155 aa  304  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  83.44 
 
 
153 aa  250  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  60.78 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  54.61 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  57.05 
 
 
153 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  60.42 
 
 
144 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  55.1 
 
 
151 aa  156  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  53.19 
 
 
167 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  55.63 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  52.82 
 
 
136 aa  138  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  51.68 
 
 
148 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  51.05 
 
 
137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  47.62 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  51.7 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  51.06 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  51.06 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  51.06 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  43.84 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  43.84 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  41.78 
 
 
139 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  43.06 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  38.89 
 
 
152 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  38.3 
 
 
150 aa  104  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  42.14 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  39.04 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  30.67 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  30.82 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  29.58 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  29.58 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  31.21 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  31.21 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  26.62 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  27.52 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  30.77 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  32 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  30.34 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  28.95 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  30 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  28.89 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  24.24 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  28.17 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  34.75 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  34.78 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  31.94 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  27.21 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  30.72 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  27.21 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  26.57 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  32.69 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  26.83 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  29.33 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  32.69 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  30.47 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  34.48 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  24.48 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.47 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  27.64 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  29.63 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  30.22 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  26.21 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  30.71 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  28.17 
 
 
140 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  28.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  30.97 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  27.94 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  32.86 
 
 
142 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  28.46 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  28.06 
 
 
141 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  25 
 
 
135 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  28.57 
 
 
142 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  27.01 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  28.46 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  28.08 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  27.2 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  24.66 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  25.36 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  31.76 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  28 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  27.97 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  25.52 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  21.21 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1765  cysteine desufuration protein SufE  27.13 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000206434  hitchhiker  0.0000210323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  27.97 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  24.11 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  26.45 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  26.77 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  23.36 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  28.26 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  26.77 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  26.47 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  26.47 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  25.56 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  29.01 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.27 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0858  Fe-S metabolism associated SufE  26.77 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>