106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1665 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  83.44 
 
 
155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  60.4 
 
 
152 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  59.73 
 
 
153 aa  163  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  60.14 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  58.16 
 
 
151 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  54.36 
 
 
150 aa  157  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  56.74 
 
 
149 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  51.43 
 
 
167 aa  144  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  55.32 
 
 
137 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  53.9 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 
138 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 
138 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 
138 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  55 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  53.9 
 
 
143 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  50 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  45.71 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  44.52 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  38.13 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  42.86 
 
 
145 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  38.46 
 
 
152 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  41.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  43.88 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  37.16 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  31.21 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  28.86 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  33.56 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  28.47 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  31.21 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  28.97 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  31.51 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  34.72 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  31.06 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  27.7 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  28.99 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  32.39 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  31.43 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  31.43 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  25.35 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  30.5 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  32.19 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  29.29 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  29.79 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  29.79 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  30.15 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  31.21 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  31.51 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  31.69 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  28.26 
 
 
140 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  32.39 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  22.73 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  26.39 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  34.07 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  30.82 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  29.5 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  34.23 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  29.27 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  27.89 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  27.87 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  27.82 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  29.45 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  27.87 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  26.43 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  26.47 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  25.74 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  29.6 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  28.28 
 
 
140 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  27.52 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  28.26 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  29.41 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  23.08 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  22.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  26.71 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  30.56 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  31.03 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  27.87 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  28.8 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  24.65 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  26.53 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  25.98 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  25.68 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3061  Fe-S metabolism associated SufE  29.8 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39110  Fe-S metabolism associated SufE  30.71 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000905619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1069  Fe-S metabolism associated SufE  31.91 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.801847  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  28.23 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.74 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  26.06 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  26.09 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  25.83 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  24.81 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  26.98 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  28.57 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1350  Fe-S metabolism associated SufE  30.92 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.590476  unclonable  0.00000000000311985 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  28.69 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  33.85 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>