184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1956 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  100 
 
 		 140 aa  282  9e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  86.33 
 
 		 147 aa  245  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  72.99 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  55.15 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0701  hypothetical protein  55.8 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  57.58 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15351  hypothetical protein  56.62 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  54.35 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  52.9 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  54.96 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  53.17 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  53.54 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  53.54 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  52.38 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  52.38 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  48.82 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  47.15 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  41.27 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_95454  conserved protein probably involved in Fe-S center assembly  46.67 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  34.59 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  36.36 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  32.8 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  33.9 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  33.9 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  38.58 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  31.45 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  40.91 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  35.34 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  41.58 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  34.33 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  33.61 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  28.12 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  36.75 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  30.83 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  40.54 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  36.96 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  32.81 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  36.09 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  35.11 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  30.6 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  35.38 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0875  Fe-S metabolism associated SufE  34.59 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0629601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  32.84 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01363  Cysteine desulfurase SufE subunit  33.07 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  32.28 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  41.75 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  37.93 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  33.57 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4099  Fe-S metabolism associated SufE  36.64 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0882  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000850545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  29.2 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  35.51 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  38.78 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  33.83 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0839  Fe-S metabolism associated SufE  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0435  Fe-S metabolism associated SufE  30.88 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  33.9 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3576  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  35.59 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  35.59 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3699  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  28.79 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0469  Fe-S metabolism associated SufE  30.88 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.19684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  39.66 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  34.13 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  36.67 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1973  SufE protein  35.25 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0681  Fe-S metabolism associated SufE  35.25 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  33.33 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3070  Fe-S metabolism associated SufE  35.25 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3508  Fe-S metabolism associated SufE  32.79 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  32.46 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  31.54 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1091  Fe-S metabolism associated SufE  35.09 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1008  Fe-S metabolism associated SufE  33.06 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000255666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2778  hypothetical protein  31.34 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0615  Fe-S metabolism associated SufE  28.79 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  31.5 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  34.23 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1840  Fe-S metabolism associated SufE  33.58 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.0307633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  34.07 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  28.23 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  30.3 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1236  Fe-S metabolism associated SufE  36.64 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0210251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0742  Fe-S metabolism associated SufE  31.97 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  30.3 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  34.23 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0752  Fe-S metabolism associated SufE  36.19 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  30.3 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  37.14 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  35.78 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  30 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>