120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0599 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0599  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3084  Fe-S metabolism associated SufE  34.23 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0119204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1625  Fe-S metabolism associated SufE  34.23 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00154018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3351  Fe-S metabolism associated SufE  31.15 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0938  Fe-S metabolism associated SufE  31.9 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00125991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  30.97 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  27.83 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2732  Fe-S metabolism associated SufE  31.03 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0725  Fe-S metabolism associated SufE  29.46 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1176  Fe-S metabolism associated SufE  26.79 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2061  Fe-S metabolism associated SufE  30.16 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0974  sufE protein  26.27 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0228427  normal  0.828222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3223  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000637476  normal  0.384907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1049  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  29.17 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0997  Fe-S metabolism associated protein  29.17 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00392215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  28.3 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3517  Fe-S metabolism associated SufE  30.63 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0960536  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0280  Fe-S metabolism associated SufE  31.58 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0896  Fe-S metabolism associated SufE  33.98 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0608769  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1199  Fe-S metabolism associated SufE  26.05 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  30.53 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1942  Fe-S metabolism associated SufE  30.63 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0211559  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  28.28 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3036  Fe-S metabolism associated SufE  25.22 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011002 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0310  hypothetical protein  31.96 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.507041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3043  putative sufE-like protein  30.33 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1777  Fe-S metabolism associated SufE  27.78 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.039925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  26.79 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2445  cysteine desufuration protein SufE  28.81 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.032262  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  29.06 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5927  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2747  cysteine desufuration protein SufE  30.51 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00745111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1753  Fe-S metabolism associated SufE  25.23 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  27.12 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1063  hypothetical protein  27.43 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11571  hypothetical protein  28.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11431  hypothetical protein  27.83 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.266355  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11581  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.561776  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  28.44 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3808  Fe-S metabolism associated SufE  27.35 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000105316  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0924  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.81 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0457641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  30.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03291  hypothetical protein  29.7 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002692  sulfur acceptor protein SufE for iron-sulfur cluster assembly  26.32 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  28.44 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2158  hypothetical protein  26.42 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3257  Fe-S metabolism associated SufE  26.96 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0705  SufE protein  26.72 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2625  Fe-S metabolism associated SufE  30.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0386264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3181  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  25.52 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0877  Fe-S metabolism associated SufE  28.81 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264737  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0893  Fe-S metabolism associated SufE  26.36 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0743449  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1672  Fe-S metabolism associated SufE  32.08 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.398454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0867  Fe-S metabolism associated SufE  26.36 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2223  Fe-S metabolism associated SufE  30.19 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1420  cysteine desulfuration protein SufE  24.55 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0902464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11391  hypothetical protein  28.32 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5125  Fe-S metabolism associated SufE  25.69 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  27.59 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  27.43 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2685  Fe-S metabolism associated SufE  25 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0574  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3380  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  27.78 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.669606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1491  Fe-S metabolism associated SufE  30.77 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0575  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0506  Fe-S metabolism associated SufE  26.27 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0176221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4443  Fe-S metabolism associated SufE  27.59 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168146  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1641  Fe-S metabolism associated SufE  29.63 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.31626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1302  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4178  Fe-S metabolism associated SufE  28.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0215  Fe-S metabolism associated SufE  28.16 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1662  Fe-S metabolism associated SufE  31.19 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4957  Fe-S metabolism associated SufE  26.55 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000286277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1912  Fe-S metabolism associated SufE  26.79 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3224  Fe-S metabolism associated SufE  24.32 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  26.13 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1897  hypothetical protein  24.55 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1746  cysteine desufuration protein SufE  26.92 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2589  cysteine desufuration protein SufE  25.96 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.403656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1852  cysteine desufuration protein SufE  25.96 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000534736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  25.23 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2952  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0280562  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02662  predicted Fe-S metabolism protein  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0877  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.721288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1472  cysteine desulfuration protein SufE  22.77 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0807  Fe-S metabolism associated SufE  28.3 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2955  cysteine desulfuration protein CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000740943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3117  cysteine desulfuration protein CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000246129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0901  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4076  cysteine desulfuration protein CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0951499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02623  hypothetical protein  26.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3059  cysteine desulfurase, sulfur acceptor subunit CsdE  26.47 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00674257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0689  conserved hypothetical protein, SufE-related protein  25.74 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0170145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0853  Fe-S metabolism associated SufE  26.53 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0835  Fe-S metabolism associated SufE  27.36 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1404  Fe-S metabolism associated SufE  25.45 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0461  cysteine desufuration protein SufE  26.96 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3132  Fe-S metabolism associated SufE  27.36 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0424  cysteine desulfuration protein SufE  29.41 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.617411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>