More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0315 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
426 aa  863    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.47 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.91 
 
 
428 aa  524  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.46 
 
 
437 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.39 
 
 
432 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.46 
 
 
437 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 
436 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.41 
 
 
426 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 
426 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 
426 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.95 
 
 
426 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.15 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.69 
 
 
429 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.65 
 
 
424 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.42 
 
 
430 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
435 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.3 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.52 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.85 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.42 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.3 
 
 
431 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 
426 aa  405  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.8 
 
 
432 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.94 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.77 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.45 
 
 
425 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.34 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.34 
 
 
432 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  49.07 
 
 
431 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.09 
 
 
425 aa  392  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 
432 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.79 
 
 
426 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.21 
 
 
436 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.45 
 
 
436 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.79 
 
 
425 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.61 
 
 
424 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.24 
 
 
453 aa  382  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 
421 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.87 
 
 
450 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
428 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.99 
 
 
425 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.65 
 
 
435 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.02 
 
 
424 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.92 
 
 
436 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.15 
 
 
436 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 
432 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.52 
 
 
431 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.8 
 
 
431 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 
424 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 
428 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.39 
 
 
432 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.99 
 
 
426 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.15 
 
 
435 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.16 
 
 
442 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 
435 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.83 
 
 
481 aa  363  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.07 
 
 
433 aa  363  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.63 
 
 
453 aa  363  4e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 
435 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.24 
 
 
475 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 
427 aa  360  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 
420 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.06 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.13 
 
 
617 aa  355  7.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.14 
 
 
441 aa  355  8.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.53 
 
 
468 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.32 
 
 
431 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.66 
 
 
460 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.18 
 
 
436 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.34 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.2 
 
 
436 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.95 
 
 
459 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.41 
 
 
426 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.15 
 
 
456 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.08 
 
 
435 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.75 
 
 
458 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
429 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.36 
 
 
425 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.07 
 
 
417 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.97 
 
 
424 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
457 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.91 
 
 
456 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.63 
 
 
480 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.91 
 
 
456 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
457 aa  345  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.68 
 
 
456 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 
463 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 
463 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.78 
 
 
489 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.18 
 
 
435 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 
430 aa  341  2e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 
473 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.59 
 
 
503 aa  335  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 
443 aa  335  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.21 
 
 
466 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>