More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3852 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  89.79 
 
 		 436 aa  773    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.45 
 
 		 437 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  75.52 
 
 		 430 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  90.95 
 
 		 436 aa  792    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.34 
 
 		 437 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  82.48 
 
 		 429 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.95 
 
 		 432 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 435 aa  890    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.45 
 
 		 432 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.59 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.47 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  61.67 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.23 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.52 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.86 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.91 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.52 
 
 		 436 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.72 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.25 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.2 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.2 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.72 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.44 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.12 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.74 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.5 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.58 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.77 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.3 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.52 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.94 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.94 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.92 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.57 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.12 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.99 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.81 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.37 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.84 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.81 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.7 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.32 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.42 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.95 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.54 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.23 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.71 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.49 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.77 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.31 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.07 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.97 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.07 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.69 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.45 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 433 aa  415  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.51 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.42 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  48 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.07 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.74 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.3 
 
 		 457 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.65 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.2 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.19 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.03 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.74 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.48 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.79 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.69 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.85 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.85 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.91 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.82 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.92 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.85 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.28 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.39 
 
 		 486 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.43 
 
 		 573 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.31 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.05 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.24 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.24 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.99 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.24 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.45 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>