More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1468 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
431 aa  894    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  71.03 
 
 
450 aa  664    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.25 
 
 
449 aa  626  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.71 
 
 
460 aa  608  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.35 
 
 
453 aa  579  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.3 
 
 
473 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.03 
 
 
453 aa  560  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.94 
 
 
468 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.23 
 
 
459 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.81 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.02 
 
 
489 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.81 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.09 
 
 
463 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.57 
 
 
457 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.09 
 
 
463 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.09 
 
 
463 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.1 
 
 
458 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.26 
 
 
466 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.49 
 
 
484 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.34 
 
 
457 aa  532  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.7 
 
 
459 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.56 
 
 
459 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.38 
 
 
456 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.28 
 
 
466 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.38 
 
 
466 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.8 
 
 
456 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.62 
 
 
456 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.62 
 
 
456 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.38 
 
 
456 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.11 
 
 
486 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.21 
 
 
481 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.85 
 
 
475 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.71 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  56 
 
 
561 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.55 
 
 
503 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  55.74 
 
 
554 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.79 
 
 
573 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.41 
 
 
617 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.06 
 
 
586 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
606 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.5 
 
 
562 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
586 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
585 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
586 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.76 
 
 
587 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.33 
 
 
573 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38085  predicted protein  55.08 
 
 
619 aa  482  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.63 
 
 
567 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 
652 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 
607 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.13 
 
 
691 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.89 
 
 
666 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.77 
 
 
628 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 
680 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.18 
 
 
578 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.88 
 
 
626 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1268  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.16 
 
 
536 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.45 
 
 
624 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
631 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.1 
 
 
627 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0455  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.56 
 
 
681 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000571171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.71 
 
 
605 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1463  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.5 
 
 
565 aa  474  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.23 
 
 
626 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.19 
 
 
601 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
631 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
631 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1859  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.53 
 
 
549 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
631 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0284  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
647 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 
655 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.1 
 
 
627 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 
631 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.07 
 
 
516 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1669  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.95 
 
 
560 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0909  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.58 
 
 
563 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.462945  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 
681 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3853  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.56 
 
 
681 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.78 
 
 
631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2110  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.22 
 
 
587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
643 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1528  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
643 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.11 
 
 
642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.22 
 
 
683 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.78 
 
 
628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4374  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.701948  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0482  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
643 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.89 
 
 
635 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
917 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  52 
 
 
630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1395  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 
643 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.78 
 
 
617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>