More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0672 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
449 aa  938    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.75 
 
 
460 aa  680    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.25 
 
 
431 aa  642    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  77.3 
 
 
450 aa  748    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.27 
 
 
459 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.73 
 
 
460 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.73 
 
 
460 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.57 
 
 
457 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.04 
 
 
458 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.57 
 
 
457 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.53 
 
 
453 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.94 
 
 
473 aa  586  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.73 
 
 
456 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.12 
 
 
463 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.41 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
456 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
456 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.12 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.26 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.12 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.95 
 
 
484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.18 
 
 
456 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.64 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.79 
 
 
459 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.32 
 
 
459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
466 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
466 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.56 
 
 
489 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.64 
 
 
453 aa  552  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.72 
 
 
562 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 
586 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 
586 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.13 
 
 
573 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 
586 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.21 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.21 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.97 
 
 
586 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.21 
 
 
586 aa  528  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.21 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.85 
 
 
573 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.21 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.97 
 
 
586 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.14 
 
 
567 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.97 
 
 
586 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.78 
 
 
561 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.51 
 
 
628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38085  predicted protein  55.96 
 
 
619 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.75 
 
 
587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.41 
 
 
606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.04 
 
 
601 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.24 
 
 
605 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.04 
 
 
624 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.01 
 
 
481 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.07 
 
 
629 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.16 
 
 
626 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.92 
 
 
625 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2592  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.68 
 
 
652 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.74 
 
 
652 aa  513  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.7 
 
 
635 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
631 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1770  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.19 
 
 
686 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.76 
 
 
627 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.65 
 
 
647 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.43 
 
 
631 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4374  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.21 
 
 
631 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.701948  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.7 
 
 
635 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.21 
 
 
631 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2201  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.66 
 
 
666 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.54 
 
 
627 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.75 
 
 
626 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.31 
 
 
617 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.25 
 
 
585 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.43 
 
 
631 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
631 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
631 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.07 
 
 
626 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.87 
 
 
683 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.49 
 
 
631 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.41 
 
 
658 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.89 
 
 
628 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  55.63 
 
 
629 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
631 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.93 
 
 
614 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.02 
 
 
917 aa  511  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.21 
 
 
624 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.32 
 
 
629 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.34 
 
 
655 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.68 
 
 
646 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.15 
 
 
666 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
631 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.07 
 
 
626 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.58 
 
 
638 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.57 
 
 
680 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.56 
 
 
631 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.21 
 
 
607 aa  508  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.21 
 
 
631 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.22 
 
 
681 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  55.77 
 
 
631 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.54 
 
 
627 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>