More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1096 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  82.16 
 
 
466 aa  808    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.95 
 
 
459 aa  842    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.26 
 
 
456 aa  816    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  82.16 
 
 
466 aa  809    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.44 
 
 
453 aa  672    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  89.82 
 
 
457 aa  866    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  87 
 
 
466 aa  843    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.55 
 
 
456 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.84 
 
 
484 aa  842    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.26 
 
 
456 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
456 aa  952    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.37 
 
 
456 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  88.47 
 
 
458 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.97 
 
 
460 aa  844    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.97 
 
 
460 aa  844    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.67 
 
 
459 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  88.72 
 
 
457 aa  853    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.46 
 
 
459 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  82.25 
 
 
486 aa  827    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.12 
 
 
463 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.12 
 
 
463 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.12 
 
 
463 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.38 
 
 
460 aa  614  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.29 
 
 
489 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.81 
 
 
453 aa  607  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.9 
 
 
468 aa  604  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.29 
 
 
473 aa  606  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.25 
 
 
562 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.73 
 
 
450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.82 
 
 
624 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.35 
 
 
666 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.74 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.14 
 
 
573 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.74 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.17 
 
 
627 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.33 
 
 
585 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.98 
 
 
586 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.74 
 
 
586 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.87 
 
 
630 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.74 
 
 
586 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.99 
 
 
567 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
561 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  59.4 
 
 
629 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.83 
 
 
629 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.52 
 
 
691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.83 
 
 
625 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.96 
 
 
614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.48 
 
 
630 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.89 
 
 
629 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.17 
 
 
629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.69 
 
 
658 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2694  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.11 
 
 
652 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.742953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.84 
 
 
606 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.78 
 
 
624 aa  558  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
629 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.01 
 
 
635 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.33 
 
 
652 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.52 
 
 
627 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.21 
 
 
516 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 
628 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
627 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.01 
 
 
629 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.4 
 
 
627 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.09 
 
 
614 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
628 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  59 
 
 
628 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.64 
 
 
635 aa  554  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.87 
 
 
614 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.4 
 
 
627 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 
627 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1197  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0705849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.75 
 
 
626 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.49 
 
 
607 aa  551  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.97 
 
 
622 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3090  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.21 
 
 
626 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1528  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0482  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1395  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.48 
 
 
680 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.44 
 
 
627 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.74 
 
 
638 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.78 
 
 
530 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.75 
 
 
626 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.64 
 
 
635 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1931  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.06 
 
 
628 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0360653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2081  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.08 
 
 
643 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.8 
 
 
647 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.78 
 
 
530 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.18 
 
 
628 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.18 
 
 
449 aa  554  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
643 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.78 
 
 
654 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>