More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2307 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.57 
 
 
463 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
489 aa  1018    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.02 
 
 
468 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.82 
 
 
453 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.31 
 
 
459 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.34 
 
 
463 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.09 
 
 
460 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.09 
 
 
460 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.34 
 
 
463 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.31 
 
 
457 aa  628  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.54 
 
 
458 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.19 
 
 
457 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.62 
 
 
486 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.83 
 
 
456 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.48 
 
 
473 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.8 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.74 
 
 
466 aa  611  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.29 
 
 
456 aa  611  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.97 
 
 
459 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.29 
 
 
459 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.83 
 
 
456 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.42 
 
 
586 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.07 
 
 
484 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.6 
 
 
456 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.66 
 
 
456 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.94 
 
 
666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.64 
 
 
627 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.66 
 
 
626 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4975  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.46 
 
 
626 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.34 
 
 
466 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.66 
 
 
629 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.76 
 
 
573 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.55 
 
 
466 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.88 
 
 
642 aa  598  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.75 
 
 
629 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.38 
 
 
586 aa  601  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.65 
 
 
654 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.66 
 
 
626 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.94 
 
 
586 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.65 
 
 
691 aa  597  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.55 
 
 
627 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.94 
 
 
586 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
586 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.5 
 
 
638 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.34 
 
 
630 aa  594  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.94 
 
 
586 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.97 
 
 
625 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.41 
 
 
629 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
561 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.17 
 
 
624 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.42 
 
 
658 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.69 
 
 
635 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
629 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.27 
 
 
606 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.67 
 
 
567 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.69 
 
 
635 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.89 
 
 
683 aa  591  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.52 
 
 
626 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
628 aa  593  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.9 
 
 
625 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2370  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.96 
 
 
630 aa  594  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.8 
 
 
630 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.86 
 
 
585 aa  592  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.07 
 
 
680 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44600  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.55 
 
 
628 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.47 
 
 
631 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  61.01 
 
 
629 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.87 
 
 
627 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.47 
 
 
626 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.41 
 
 
630 aa  588  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.4 
 
 
460 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.59 
 
 
628 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4728  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.67 
 
 
628 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.3 
 
 
453 aa  585  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002072  thiamin biosynthesis protein ThiC  60.04 
 
 
646 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3464  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.38 
 
 
639 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.01 
 
 
609 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4496  thiamine biosynthesis protein ThiC  63 
 
 
631 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4494  thiamine biosynthesis protein ThiC  63 
 
 
631 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0642711  normal  0.0188033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.78 
 
 
631 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0216  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.49 
 
 
651 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.8 
 
 
630 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.79 
 
 
628 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.79 
 
 
607 aa  587  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.93 
 
 
655 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1931  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
628 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1316  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
630 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.91 
 
 
617 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.66 
 
 
627 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.17 
 
 
647 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0220  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.49 
 
 
646 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.464551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.29 
 
 
647 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.04 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1770  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.34 
 
 
686 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0347  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.89 
 
 
681 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>