More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18211 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  94.3 
 
 
456 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
456 aa  954    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.78 
 
 
466 aa  850    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.74 
 
 
457 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.26 
 
 
458 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.74 
 
 
457 aa  789    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.82 
 
 
460 aa  779    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.78 
 
 
466 aa  827    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.68 
 
 
484 aa  830    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  88 
 
 
466 aa  851    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  98.9 
 
 
456 aa  946    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.26 
 
 
456 aa  816    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.89 
 
 
459 aa  825    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.82 
 
 
460 aa  779    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.39 
 
 
459 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.77 
 
 
453 aa  677    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  76.47 
 
 
486 aa  769    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.18 
 
 
459 aa  832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  99.34 
 
 
456 aa  948    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.08 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.83 
 
 
489 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.98 
 
 
468 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.19 
 
 
453 aa  595  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
473 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.18 
 
 
450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
449 aa  558  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.5 
 
 
562 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
586 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.88 
 
 
567 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.14 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.38 
 
 
573 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.11 
 
 
561 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
586 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
586 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
586 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
586 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.27 
 
 
630 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
587 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.29 
 
 
647 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.24 
 
 
624 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.07 
 
 
652 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.86 
 
 
629 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
481 aa  537  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.77 
 
 
475 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.56 
 
 
625 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.84 
 
 
666 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.45 
 
 
658 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.13 
 
 
614 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.69 
 
 
627 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.81 
 
 
635 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.96 
 
 
635 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.99 
 
 
516 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.69 
 
 
627 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.95 
 
 
573 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.1 
 
 
606 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.87 
 
 
585 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.81 
 
 
635 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1523  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.27 
 
 
631 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428931  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.6 
 
 
622 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.3 
 
 
631 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.53 
 
 
614 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.37 
 
 
629 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.8 
 
 
691 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.57 
 
 
607 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2694  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
652 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.742953  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.72 
 
 
624 aa  528  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.53 
 
 
614 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.28 
 
 
605 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.17 
 
 
628 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1268  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
536 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.8 
 
 
628 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 
530 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.49 
 
 
630 aa  531  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.9 
 
 
627 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.56 
 
 
626 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.4 
 
 
629 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.18 
 
 
629 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0958  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.53 
 
 
618 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.4 
 
 
601 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  55.94 
 
 
629 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.87 
 
 
626 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.37 
 
 
629 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.05 
 
 
626 aa  527  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.56 
 
 
638 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 
625 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.62 
 
 
431 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.24 
 
 
530 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.74 
 
 
627 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.61 
 
 
619 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.53 
 
 
627 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.01 
 
 
617 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
480 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>