More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3400 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.13 
 
 
631 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.13 
 
 
631 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0482  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
643 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0754  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.48 
 
 
528 aa  688    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.03 
 
 
626 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2110  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.8 
 
 
587 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.675546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.53 
 
 
624 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.06 
 
 
631 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.96 
 
 
586 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.58 
 
 
658 aa  717    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0446  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.79 
 
 
611 aa  706    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2445  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.5 
 
 
721 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  61.09 
 
 
629 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.79 
 
 
586 aa  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.96 
 
 
586 aa  772    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.96 
 
 
586 aa  772    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3090  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
643 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.93 
 
 
629 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.9 
 
 
691 aa  746    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3921  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.77 
 
 
638 aa  738    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.68 
 
 
530 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.56 
 
 
626 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0278  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.33 
 
 
565 aa  647    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0019  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.39 
 
 
638 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.691133  normal  0.432221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2694  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.78 
 
 
652 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.742953  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2468  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.98 
 
 
646 aa  708    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.62 
 
 
619 aa  728    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1528  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.35 
 
 
643 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.41 
 
 
624 aa  744    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.6 
 
 
629 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0337  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.69 
 
 
596 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4331  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.48 
 
 
643 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0917809  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4174  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.54 
 
 
610 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772115  normal  0.0881714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.91 
 
 
607 aa  733    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.86 
 
 
666 aa  750    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2452  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.13 
 
 
645 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.33 
 
 
630 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.2 
 
 
630 aa  780    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.79 
 
 
586 aa  771    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1395  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.35 
 
 
643 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.92 
 
 
683 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6226  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.57 
 
 
633 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642096  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.12 
 
 
635 aa  745    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2008  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.08 
 
 
621 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.578808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
643 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0360653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2844  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.86 
 
 
648 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0965  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.82 
 
 
606 aa  710    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.831801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.78 
 
 
652 aa  756    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1954  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.49 
 
 
646 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.36 
 
 
626 aa  732    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0798  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.88 
 
 
554 aa  654    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1708  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 
624 aa  762    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.998594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.36 
 
 
638 aa  742    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2162  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.29 
 
 
709 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.1 
 
 
628 aa  741    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0037  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.71 
 
 
638 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1449  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.83 
 
 
643 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1770  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.42 
 
 
686 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1523  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
631 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428931  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3432  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.63 
 
 
641 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0959  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
633 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2896  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.94 
 
 
643 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.87 
 
 
628 aa  729    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.69 
 
 
625 aa  742    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0041  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.16 
 
 
622 aa  680    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.321035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.87 
 
 
626 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1924  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.88 
 
 
609 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471562  normal  0.405716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2054  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.33 
 
 
608 aa  706    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2370  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.33 
 
 
630 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0742  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.65 
 
 
643 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1931  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.1 
 
 
628 aa  738    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2561  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.25 
 
 
608 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.61 
 
 
630 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.88 
 
 
627 aa  736    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.69 
 
 
628 aa  756    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.32 
 
 
647 aa  729    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1881  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.68 
 
 
720 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2097  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.51 
 
 
720 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1316  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.38 
 
 
630 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2201  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.67 
 
 
666 aa  701    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.95 
 
 
617 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0569  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.17 
 
 
623 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000923464  decreased coverage  0.00000172451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1105  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.48 
 
 
643 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.93 
 
 
627 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  76.54 
 
 
626 aa  895    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1223  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.65 
 
 
643 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.03 
 
 
614 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1922  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.59 
 
 
712 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1936  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.51 
 
 
720 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.24 
 
 
585 aa  798    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.35 
 
 
643 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1034  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.16 
 
 
592 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1197  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
643 aa  750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0705849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10428  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.7 
 
 
547 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00121704  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2944  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
599 aa  715    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.858401  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
561 aa  1164    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1860  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.39 
 
 
664 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0360  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.66 
 
 
656 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.556532  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0725  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.79 
 
 
516 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.19 
 
 
654 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>