More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18041 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.3 
 
 
458 aa  780    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.67 
 
 
459 aa  824    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  94.47 
 
 
456 aa  908    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.56 
 
 
466 aa  848    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.82 
 
 
460 aa  782    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.54 
 
 
453 aa  676    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.51 
 
 
457 aa  789    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
456 aa  954    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.56 
 
 
466 aa  826    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.87 
 
 
484 aa  828    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  98.46 
 
 
456 aa  940    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.55 
 
 
456 aa  814    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.78 
 
 
466 aa  849    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.51 
 
 
457 aa  787    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  99.34 
 
 
456 aa  948    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.96 
 
 
459 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  76.26 
 
 
486 aa  767    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  80.18 
 
 
459 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.82 
 
 
460 aa  782    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.83 
 
 
489 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.08 
 
 
460 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.98 
 
 
468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.67 
 
 
463 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.19 
 
 
453 aa  597  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.66 
 
 
473 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.41 
 
 
450 aa  585  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.28 
 
 
449 aa  558  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.72 
 
 
562 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.37 
 
 
586 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.61 
 
 
573 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
586 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.07 
 
 
561 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.45 
 
 
624 aa  541  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.48 
 
 
630 aa  541  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.88 
 
 
567 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.09 
 
 
587 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.44 
 
 
625 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.06 
 
 
666 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.4 
 
 
481 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.29 
 
 
647 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.67 
 
 
658 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.32 
 
 
614 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.69 
 
 
627 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.17 
 
 
635 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
573 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.03 
 
 
635 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.34 
 
 
606 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0500  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.08 
 
 
629 aa  537  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.71 
 
 
630 aa  535  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.03 
 
 
635 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.22 
 
 
516 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.92 
 
 
585 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.69 
 
 
627 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.4 
 
 
629 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.51 
 
 
631 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.77 
 
 
475 aa  534  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.02 
 
 
691 aa  532  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2694  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.98 
 
 
652 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.742953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.59 
 
 
629 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.07 
 
 
652 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.51 
 
 
605 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.61 
 
 
628 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.02 
 
 
628 aa  531  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.62 
 
 
629 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 
627 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1523  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.05 
 
 
631 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428931  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.47 
 
 
530 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1268  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.43 
 
 
536 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.37 
 
 
629 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0205  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 
626 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.08 
 
 
624 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.99 
 
 
614 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.27 
 
 
626 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0369  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.77 
 
 
638 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2971  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.99 
 
 
614 aa  529  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0162  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.3 
 
 
625 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268503  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.3 
 
 
530 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.82 
 
 
622 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.96 
 
 
627 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
480 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.83 
 
 
619 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.74 
 
 
627 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.56 
 
 
626 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.22 
 
 
617 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  55.94 
 
 
629 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.16 
 
 
626 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0609  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.16 
 
 
627 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0958  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.76 
 
 
618 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.74 
 
 
609 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>