More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1278 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.3 
 
 		 459 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.54 
 
 		 466 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.54 
 
 		 456 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.89 
 
 		 459 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.54 
 
 		 466 aa  670    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.79 
 
 		 468 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  72 
 
 		 457 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.67 
 
 		 460 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.58 
 
 		 453 aa  684    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.59 
 
 		 463 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.83 
 
 		 466 aa  664    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.37 
 
 		 484 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.77 
 
 		 456 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  70.44 
 
 		 456 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.59 
 
 		 463 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 453 aa  941    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.24 
 
 		 459 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.59 
 
 		 463 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.44 
 
 		 457 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.45 
 
 		 458 aa  695    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  68.82 
 
 		 489 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.3 
 
 		 456 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  66.46 
 
 		 486 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  72.67 
 
 		 460 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.77 
 
 		 456 aa  677    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.68 
 
 		 460 aa  627  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.43 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.95 
 
 		 450 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.25 
 
 		 652 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.03 
 
 		 586 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.8 
 
 		 586 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.28 
 
 		 562 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.07 
 
 		 585 aa  591  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.76 
 
 		 561 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.8 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.8 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.79 
 
 		 606 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.3 
 
 		 624 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0019  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.28 
 
 		 638 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.691133  normal  0.432221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.73 
 
 		 475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.76 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0037  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.28 
 
 		 638 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  64 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.35 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.67 
 
 		 658 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.88 
 
 		 629 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.23 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.66 
 
 		 573 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.04 
 
 		 573 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.42 
 
 		 666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03871  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4000  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2430  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.35 
 
 		 628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.66 
 
 		 629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.48 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4031  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0125326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  64.32 
 
 		 601 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  63.32 
 
 		 554 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4228  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4536  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.47 
 
 		 631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3661  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.56 
 
 		 614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.02 
 
 		 627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03824  hypothetical protein  62.25 
 
 		 631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0829  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.04 
 
 		 617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4485  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.03 
 
 		 631 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4922  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.66 
 
 		 626 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0113  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.17 
 
 		 631 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.285617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  60.22 
 
 		 629 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 655 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.53 
 
 		 449 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.83 
 
 		 607 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4570  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.81 
 
 		 631 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0133622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5462  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.25 
 
 		 631 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.416651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00366  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.93 
 
 		 646 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.07 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.83 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4407  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.81 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.3 
 
 		 627 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1824  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.98 
 
 		 626 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.484584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.19 
 
 		 630 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2313  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.26 
 
 		 647 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4442  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.81 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000546852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.96 
 
 		 627 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3201  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.31 
 
 		 619 aa  569  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.814938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4798  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.66 
 
 		 626 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3642  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.22 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.13 
 
 		 630 aa  568  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0207  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.03 
 
 		 630 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4728  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.83 
 
 		 628 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3175  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.47 
 
 		 611 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.81 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3318  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.22 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.96 
 
 		 627 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>