More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2472 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.07 
 
 
503 aa  678    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
481 aa  980    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.33 
 
 
480 aa  707    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.4 
 
 
475 aa  690    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.82 
 
 
453 aa  566  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.88 
 
 
468 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.36 
 
 
489 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.36 
 
 
573 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.75 
 
 
587 aa  548  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.36 
 
 
562 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.3 
 
 
457 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.93 
 
 
460 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.57 
 
 
573 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.52 
 
 
457 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.93 
 
 
460 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  62.91 
 
 
554 aa  545  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.37 
 
 
548 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.5 
 
 
605 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.74 
 
 
607 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.81 
 
 
547 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.53 
 
 
459 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.35 
 
 
626 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.84 
 
 
458 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.4 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.05 
 
 
453 aa  540  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.65 
 
 
561 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
456 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
463 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
463 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.38 
 
 
606 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
463 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.16 
 
 
456 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.53 
 
 
586 aa  531  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
586 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.94 
 
 
484 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.95 
 
 
578 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.12 
 
 
564 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.12 
 
 
466 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.77 
 
 
456 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.31 
 
 
567 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
456 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.1 
 
 
459 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.76 
 
 
586 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.82 
 
 
585 aa  531  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.47 
 
 
629 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.79 
 
 
629 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  60 
 
 
652 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10428  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.91 
 
 
547 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00121704  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.55 
 
 
628 aa  525  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.35 
 
 
568 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1924  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.64 
 
 
609 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471562  normal  0.405716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.47 
 
 
530 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0725  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.12 
 
 
516 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.47 
 
 
530 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0019  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.2 
 
 
638 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.691133  normal  0.432221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.64 
 
 
658 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2694  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.2 
 
 
652 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.742953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.72 
 
 
629 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.26 
 
 
683 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.14 
 
 
516 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.01 
 
 
486 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.35 
 
 
666 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1268  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.23 
 
 
536 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.48 
 
 
607 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.48 
 
 
624 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.72 
 
 
466 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.9 
 
 
624 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.09 
 
 
625 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.83 
 
 
601 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.15 
 
 
630 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0550  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.67 
 
 
622 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3737  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.24 
 
 
566 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.871211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0037  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.39 
 
 
638 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.08 
 
 
627 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1316  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.18 
 
 
630 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.13 
 
 
459 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.65 
 
 
627 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  55.03 
 
 
629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1064  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.48 
 
 
627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.932567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.25 
 
 
629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0086  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.9 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3921  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.49 
 
 
638 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.02 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.24 
 
 
466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0892  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.82 
 
 
885 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.06 
 
 
630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.58 
 
 
614 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.51 
 
 
609 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.64 
 
 
642 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0948  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.48 
 
 
627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.92 
 
 
917 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3464  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.59 
 
 
639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>