More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1332 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  88.07 
 
 
503 aa  807    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
480 aa  983    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  74.33 
 
 
481 aa  729    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  81.7 
 
 
475 aa  757    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.29 
 
 
453 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.84 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  65.14 
 
 
489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.84 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.3 
 
 
458 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.15 
 
 
468 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.39 
 
 
459 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.47 
 
 
457 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.8 
 
 
562 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.93 
 
 
457 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07900  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.5 
 
 
607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0286039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.19 
 
 
578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.24 
 
 
573 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  64 
 
 
587 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.59 
 
 
459 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.7 
 
 
459 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.98 
 
 
585 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.52 
 
 
573 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.48 
 
 
466 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.89 
 
 
456 aa  552  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.14 
 
 
453 aa  554  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.05 
 
 
486 aa  551  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.65 
 
 
626 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  62.68 
 
 
554 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
456 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.03 
 
 
605 aa  554  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.5 
 
 
547 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.2 
 
 
456 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.65 
 
 
530 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.26 
 
 
586 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.26 
 
 
586 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.82 
 
 
606 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  63.25 
 
 
484 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
456 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.73 
 
 
548 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.26 
 
 
586 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.8 
 
 
586 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.03 
 
 
586 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
466 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.18 
 
 
530 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.92 
 
 
466 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.56 
 
 
652 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.36 
 
 
568 aa  548  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.72 
 
 
456 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  61.41 
 
 
561 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.68 
 
 
463 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0078  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.62 
 
 
627 aa  541  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.89 
 
 
567 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
463 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  62.44 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0140  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.67 
 
 
629 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.579099  normal  0.193074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0487  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.67 
 
 
629 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.55 
 
 
564 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2466  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
627 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.387254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.67 
 
 
516 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.67 
 
 
601 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2828  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.46 
 
 
624 aa  534  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0492  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.07 
 
 
629 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0943388  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2096  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.75 
 
 
683 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.76 
 
 
460 aa  533  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1924  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.54 
 
 
609 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.471562  normal  0.405716 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.96 
 
 
450 aa  532  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2710  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.1 
 
 
624 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0250  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.75 
 
 
658 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.18 
 
 
630 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.26 
 
 
630 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0093  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.12 
 
 
628 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447286  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00146  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.19 
 
 
642 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2561  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.52 
 
 
608 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0240  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.62 
 
 
630 aa  531  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0019  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.29 
 
 
638 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.691133  normal  0.432221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0803  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.97 
 
 
654 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4976  thiamin biosynthesis protein ThiC  55.19 
 
 
629 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.71 
 
 
431 aa  528  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0544  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.41 
 
 
629 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0621  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.95 
 
 
609 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5702  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.96 
 
 
627 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2430  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.37 
 
 
628 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1523  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.24 
 
 
631 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428931  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2285  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.08 
 
 
635 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4714  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.41 
 
 
628 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.35194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.31 
 
 
625 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2530  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.21 
 
 
628 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0037  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.08 
 
 
638 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1603  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.16 
 
 
607 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2272  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.46 
 
 
666 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1316  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.87 
 
 
630 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0896  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.42 
 
 
647 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.116715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65740  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.96 
 
 
627 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3325  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.48 
 
 
614 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.982769  normal  0.431708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>