More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4183 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  89.66 
 
 		 435 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.91 
 
 		 436 aa  762    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  88.74 
 
 		 435 aa  817    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.36 
 
 		 435 aa  801    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 435 aa  899    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  86.9 
 
 		 435 aa  797    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  88.51 
 
 		 435 aa  815    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  60.14 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.37 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.87 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.13 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.92 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.69 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.98 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.16 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.64 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.03 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.47 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.34 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.98 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.43 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.87 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.23 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.51 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.33 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  48.35 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.95 
 
 		 426 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.19 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.95 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.57 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.75 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.27 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.22 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.14 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  47 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.52 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.26 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.62 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.22 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.59 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.09 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.49 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.99 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.57 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.94 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.18 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.71 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.9 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.15 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.37 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.42 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  45 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.29 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.33 
 
 		 466 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.57 
 
 		 466 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.37 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.1 
 
 		 425 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.76 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.52 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.06 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.52 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 		 460 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 		 460 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.33 
 
 		 456 aa  353  5e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.43 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 		 548 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.42 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.16 
 
 		 564 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 		 433 aa  348  8e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.84 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4530  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.77 
 
 		 627 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1629  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.73 
 
 		 630 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984407  normal  0.732533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.47 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.36 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.16 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1610  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.34 
 
 		 630 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0307755  normal  0.0806317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.69 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1891  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.34 
 
 		 630 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0976553  normal  0.536126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>