More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0139 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 424 aa  867    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  75.71 
 
 		 425 aa  689    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  99.53 
 
 		 424 aa  864    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.59 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.92 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.37 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.36 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.24 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.96 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.35 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.65 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.64 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 436 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.42 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.41 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.37 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.47 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  50.95 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.3 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.8 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.42 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.88 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.33 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.11 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.64 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.64 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.65 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.94 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.88 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.3 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.09 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.59 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.65 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.28 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.2 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.24 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.78 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.42 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.96 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.41 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.2 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.76 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.58 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.29 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.76 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.62 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.56 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.8 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.59 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.51 
 
 		 586 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.37 
 
 		 564 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.35 
 
 		 457 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.56 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2440  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.07 
 
 		 578 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00485552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.05 
 
 		 586 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.05 
 
 		 586 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 586 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.51 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.82 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1669  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.22 
 
 		 560 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.84 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 		 548 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.85 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.68 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.4 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.69 
 
 		 917 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.21 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0798  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.72 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.81 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1454  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.55 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.323414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.81 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.81 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2227  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.09 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.32 
 
 		 626 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.02 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.6 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.48 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.82 
 
 		 426 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8813  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.05 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.37 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0425  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.73 
 
 		 547 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.912132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.73 
 
 		 652 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  46.28 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.09 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0052  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.5 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>