More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1558 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 424 aa  874    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  79.76 
 
 		 426 aa  724    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  84 
 
 		 425 aa  763    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  80 
 
 		 425 aa  735    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.67 
 
 		 424 aa  773    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  73.41 
 
 		 427 aa  649    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  69.01 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.06 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  56 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.11 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.16 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.87 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.94 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.24 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.85 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.06 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.24 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.33 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.18 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.53 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.62 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.05 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.9 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.62 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.12 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.71 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.12 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.64 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.47 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  49.41 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.24 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.53 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.7 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.54 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.65 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.27 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.17 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.54 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.81 
 
 		 430 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.43 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.29 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.48 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.37 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.37 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.48 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.76 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.02 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.59 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.11 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.88 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0053  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.24 
 
 		 428 aa  362  9e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2459  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.85 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.78 
 
 		 432 aa  358  8e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 		 453 aa  358  8e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0044  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.54 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.59 
 
 		 458 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.58 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 		 456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.53 
 
 		 456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.47 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 		 457 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.63 
 
 		 466 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.05 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 		 460 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.15 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.94 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.41 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 		 456 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.91 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.39 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.34 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.58 
 
 		 430 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.72 
 
 		 468 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.62 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.87 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.29 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.31 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.11 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 		 481 aa  336  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0200  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.71 
 
 		 421 aa  335  7e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00649886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2464  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.38 
 
 		 486 aa  335  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.86 
 
 		 617 aa  331  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>