More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3677 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.22 
 
 		 435 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.29 
 
 		 435 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.75 
 
 		 435 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  85.06 
 
 		 435 aa  768    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  83.91 
 
 		 435 aa  762    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 		 436 aa  900    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  84.14 
 
 		 435 aa  762    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.43 
 
 		 428 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  58.55 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.56 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.85 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.14 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.41 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.5 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.05 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.74 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.03 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.24 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.52 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.57 
 
 		 437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.57 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.04 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.7 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.52 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  48.46 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.69 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.94 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.22 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.46 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.56 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.8 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.56 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.96 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.2 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.72 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.04 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.88 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.06 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.61 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.25 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.17 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.27 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.1 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.96 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.47 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.82 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.23 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.74 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  44 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.6 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.63 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.74 
 
 		 484 aa  362  9e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.05 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.22 
 
 		 466 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.5 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.39 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 		 457 aa  358  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.39 
 
 		 430 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.43 
 
 		 460 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.78 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.78 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.32 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.02 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.08 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.87 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.5 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.54 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.18 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.75 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.54 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.6 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34570  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.82 
 
 		 548 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.49 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0650  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 		 457 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.06 
 
 		 463 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.06 
 
 		 463 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.27 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.06 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.22 
 
 		 564 aa  346  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.62 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2487  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 		 626 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.6 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 		 567 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>