More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1596 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
432 aa  895    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  59.72 
 
 
432 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.78 
 
 
432 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.24 
 
 
432 aa  478  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.99 
 
 
434 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.08 
 
 
432 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.16 
 
 
432 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.7 
 
 
432 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  50.46 
 
 
431 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.22 
 
 
429 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.57 
 
 
431 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.54 
 
 
431 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.71 
 
 
437 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.31 
 
 
436 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 
436 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
437 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.95 
 
 
432 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.59 
 
 
430 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.36 
 
 
435 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.17 
 
 
426 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.15 
 
 
426 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.97 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.03 
 
 
424 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.68 
 
 
426 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.21 
 
 
426 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.44 
 
 
426 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.06 
 
 
426 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.74 
 
 
426 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.73 
 
 
435 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.27 
 
 
436 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 
435 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.8 
 
 
435 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 
435 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.26 
 
 
436 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.24 
 
 
427 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.79 
 
 
436 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.86 
 
 
424 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 
425 aa  385  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.57 
 
 
435 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.16 
 
 
435 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 
424 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 
425 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.92 
 
 
425 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.06 
 
 
428 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  44 
 
 
428 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.55 
 
 
424 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.26 
 
 
429 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.97 
 
 
432 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.33 
 
 
429 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.12 
 
 
453 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.48 
 
 
436 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.24 
 
 
436 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.35 
 
 
431 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
428 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.35 
 
 
431 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.57 
 
 
426 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.39 
 
 
460 aa  363  3e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.68 
 
 
460 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.68 
 
 
460 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.44 
 
 
459 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.96 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.1 
 
 
481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.68 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.92 
 
 
453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.89 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.12 
 
 
456 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1663  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.91 
 
 
429 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275056  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.86 
 
 
473 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.12 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
456 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
457 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0628  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.23 
 
 
426 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.99 
 
 
489 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
456 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.2 
 
 
431 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 
484 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.87 
 
 
436 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 
475 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.87 
 
 
480 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42 
 
 
466 aa  345  6e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 
430 aa  345  6e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.26 
 
 
456 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 
463 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 
463 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.05 
 
 
425 aa  345  8e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.77 
 
 
457 aa  345  8e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.03 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.16 
 
 
459 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
586 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.18 
 
 
573 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.3 
 
 
426 aa  342  7e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.09 
 
 
530 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  41 
 
 
459 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.71 
 
 
561 aa  342  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.45 
 
 
466 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.07 
 
 
567 aa  342  9e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.22 
 
 
466 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.03 
 
 
442 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.37 
 
 
443 aa  341  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>