More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1450 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2747  thiamine biosynthesis protein ThiC  67.45 
 
 
433 aa  638    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0530  thiamine biosynthesis protein ThiC  96.98 
 
 
443 aa  822    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0702223  normal  0.172479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1450  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
430 aa  874    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.582208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.46 
 
 
435 aa  480  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.2 
 
 
442 aa  403  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.88 
 
 
432 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  47.72 
 
 
431 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 
434 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.73 
 
 
432 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.48 
 
 
431 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.36 
 
 
432 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1173  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.95 
 
 
427 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  47 
 
 
431 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.67 
 
 
432 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3677  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.32 
 
 
436 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.286824  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0787  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.95 
 
 
425 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.346957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1722  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.99 
 
 
426 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00870726  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.78 
 
 
436 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3005  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.56 
 
 
435 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4183  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.84 
 
 
435 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1711  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.63 
 
 
425 aa  361  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3893  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.43 
 
 
435 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.377066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1558  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.55 
 
 
424 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.635884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1595  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
425 aa  359  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.753357  normal  0.11929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3809  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.19 
 
 
435 aa  359  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2809  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.95 
 
 
435 aa  359  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.63 
 
 
431 aa  358  7e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.3 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0597  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.76 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0471  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.26 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.36 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0315  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.4 
 
 
426 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.326801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.33 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.85 
 
 
426 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
424 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.22 
 
 
426 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.82 
 
 
436 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.09 
 
 
429 aa  354  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.61 
 
 
426 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.15 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1712  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.04 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.91 
 
 
426 aa  352  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.14 
 
 
426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.4 
 
 
428 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.89 
 
 
436 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.91 
 
 
437 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.67 
 
 
437 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.13 
 
 
436 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1977  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.36 
 
 
424 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.67 
 
 
432 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1596  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.08 
 
 
432 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.91 
 
 
431 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.84 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
436 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.28 
 
 
453 aa  339  5e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2472  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.84 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.709563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.94 
 
 
453 aa  333  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.81 
 
 
450 aa  333  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.09 
 
 
420 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 
430 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1332  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.38 
 
 
480 aa  331  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.61 
 
 
460 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.42 
 
 
468 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1359  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.13 
 
 
428 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.046519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.1 
 
 
430 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1723  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.6 
 
 
432 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414436  normal  0.578112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1494  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.42 
 
 
427 aa  329  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.62 
 
 
430 aa  328  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1597  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.88 
 
 
426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.5 
 
 
432 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.37 
 
 
431 aa  324  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2297  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.3 
 
 
475 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 
433 aa  323  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.72 
 
 
417 aa  322  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.38 
 
 
449 aa  322  8e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1592  thiamine biosynthesis protein ThiC  38.64 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000634578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3883  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.76 
 
 
530 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.28 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.9 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.05 
 
 
466 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.72 
 
 
456 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.67 
 
 
473 aa  318  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3703  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.38 
 
 
564 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4274  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.52 
 
 
530 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662161  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0416  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.79 
 
 
432 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2593  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.47 
 
 
503 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.28 
 
 
459 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.24 
 
 
456 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  41.13 
 
 
561 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.9 
 
 
460 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.61 
 
 
484 aa  317  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.9 
 
 
460 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.62 
 
 
456 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.19 
 
 
459 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1848  thiamine biosynthesis protein ThiC  40.33 
 
 
415 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.487586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>