More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0373 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0373  thiamine biosynthesis protein ThiC  100 
 
 
420 aa  869    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1661  thiamine biosynthesis protein ThiC  57.97 
 
 
417 aa  501  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0670  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.77 
 
 
436 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0668  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.53 
 
 
436 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1684  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.97 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000247869  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1991  thiamine biosynthesis protein ThiC  55.4 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1114  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.61 
 
 
431 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0602  thiamine biosynthesis protein ThiC  56.59 
 
 
432 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1025  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.35 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.744635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0503  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.59 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.176091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0478  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.86 
 
 
430 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1485  thiamine biosynthesis protein ThiC  54.11 
 
 
430 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2776  thiamine biosynthesis protein ThiC  50 
 
 
429 aa  428  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00094064  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0643  thiamine biosynthesis protein ThiC  53.7 
 
 
424 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00241132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0701  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.72 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2064  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.6 
 
 
441 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.27669  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1401  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.45 
 
 
432 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0775  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.52 
 
 
431 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_681  thiamine biosynthesis protein  50.24 
 
 
431 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.383158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3463  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.76 
 
 
437 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2018  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.6 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3529  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.52 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0104  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.09 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.64083  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0410  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.18 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2518  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.69 
 
 
432 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1421  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.75 
 
 
425 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2910  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.16 
 
 
436 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0974  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.98 
 
 
432 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893445  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1486  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.34 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.680107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3734  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.06 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2596  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.86 
 
 
432 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.545863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.88 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0604  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.33 
 
 
436 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3852  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.45 
 
 
435 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0141  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.69 
 
 
424 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0672  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.17 
 
 
449 aa  398  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.936222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2890  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.69 
 
 
432 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000275023  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1489  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.85 
 
 
426 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2129  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.15 
 
 
428 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2236  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.08 
 
 
430 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2427  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.82 
 
 
426 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0139  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.45 
 
 
424 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2764  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.93 
 
 
429 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0765  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.65 
 
 
426 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3442  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 
460 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.309449  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1103  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.14 
 
 
453 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1189  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.65 
 
 
426 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1742  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.57 
 
 
617 aa  388  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2167  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.38 
 
 
468 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188885  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2662  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.28 
 
 
460 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0145  thiamine biosynthesis protein ThiC  49.64 
 
 
434 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1186  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.17 
 
 
426 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.618429  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1249  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.82 
 
 
562 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2045  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.41 
 
 
436 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99165  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4908  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
586 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4920  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
586 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1096  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.02 
 
 
456 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0295127  normal  0.0112677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1468  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.04 
 
 
431 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000710454  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0703  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.95 
 
 
429 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4020  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.12 
 
 
457 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5316  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.18 
 
 
586 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.03557e-31 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3220  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.88 
 
 
458 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.182052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0543  thiamine biosynthesis protein ThiC  42.58 
 
 
442 aa  375  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.762964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5341  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5076  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1908  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.19 
 
 
459 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0357  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.88 
 
 
457 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0167  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.02 
 
 
466 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0123  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.27 
 
 
484 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5463  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0529454  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18041  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 
456 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01971  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.78 
 
 
459 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18211  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.81 
 
 
456 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5398  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.507246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5018  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.71 
 
 
586 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0374  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.41 
 
 
573 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3762  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.94 
 
 
586 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0906  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.71 
 
 
435 aa  378  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.598412  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1188  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.82 
 
 
466 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5347  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.71 
 
 
586 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5612  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.71 
 
 
586 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.188984  hitchhiker  0.0000000000000085296 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1704  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.58 
 
 
456 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1643  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.19 
 
 
463 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17991  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.05 
 
 
456 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0367  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.69 
 
 
436 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2304  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.19 
 
 
463 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5222  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.28 
 
 
567 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2216  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.19 
 
 
463 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.455315  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20631  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.82 
 
 
466 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.017014  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17361  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.3 
 
 
459 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19710  hydroxymethylpyrimidine synthase  43.53 
 
 
554 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19694  hitchhiker  0.00821817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2307  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.02 
 
 
489 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5609  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.85 
 
 
606 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567176  decreased coverage  0.000155826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0148  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.64 
 
 
630 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2653  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.47 
 
 
573 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0383  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.13 
 
 
652 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3400  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.06 
 
 
561 aa  364  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.557374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0916  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.29 
 
 
516 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584665  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2392  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.2 
 
 
680 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.494213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3870  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.14 
 
 
655 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>